Ciao...
neanche io sono del settore specifico, ma ritengo che se si deve fare una ricerca di shelf life, dal punto di vista microbiologico, è inutile andare a ricercare microrganismi che comunque non devono essere presenti (limite zero). Mi concentrerei sugli "indicatori" quali coliformi, carica batterica, ...,.
Non dimenticherei, per ricerche di routine, anche il Bacillus cereus, che è pericoloso per le sostanze ad alto tenore di amido.
spero di esser stato utile
saluti
Emanuele