In effetti la normativa sui funghi non è particolarmente abbondante.
Al DM da te citato, posso aggiungere il DPR 14 luglio 1995 n. 376 (pubblicato in G.U. n°212 del 11/09/1995) - Regolamento concernente la disciplina della raccolta e della commercializzazione dei funghi epigei freschi e conservati.
Quanto al Regolamento (CE) n. 1661/1999, come forse avrai già notato, è stato abrogato dal Regolamento (CE) n. 1635/2006.
Ciao e auguri per la prossima laurea.